روش درمان، توسط پزشک شما و بر اساس سن، سابقه ی بیماری ها و تشخیص خود شما انتخاب می شود. در حال حاضر هیچ روش مشخصی برای تشخیص و یا درمان قطعی سیستیت بینابینی وجود ندارد. از این رو، درمان CI، عمدتاً شامل از بین بردن علائم آن می شود:

1_درمان سیستیت بینابینی با انبساط مثانه

این عمل به منظور افزایش حجم مثانه و مداخله در سیگنال های دردی است که از سلول های عصبی مثانه شروع می شوند. 

2_شست و شوی مثانه

که با نام “حمام مثانه” شناخته می شود. طی این عمل، مثانه با محلولی خاص برای مدت های متفاوت (از چند ثانیه تا 15 دقیقه) پر شده و سپس توسط سوند خالی می شود.

3_ درمان دارویی

تجویز دارو بسته به علائم و تشخیص پزشک متخصص است.

4_تحریک الکتریکی عصب از راه پوست (TENS)

پالس های آرام الکتریکی، طی دقایق یا ساعت های پی در پی، دو یا چند بار در روز، از طریق سیم های نصب شده روی کمر، یا دستگاه خاص نصب شده درون واژن برای زنان، یا مقعد برای مردان، به بدن وارد می شوند. 

5_ ورزش مثانه

بیمار با خالی کردن مثانه در زمان های مقرر و استفاده از تکنیک های آرامش و مدیتیشن، سعی می کند طبق برنامه ای خاص ادرار خود را تنظیم کند. به مرور زمان، بیمار می تواند فاصله ی بین ادرار ها را افزایش دهد.

6_ درمان مثانه دردناک با جراحی

کنترل سیستیت بینابینی می تواند شامل این موارد باشد:

7_تغییر در رژیم غذایی

هیچ مدرک پزشکی در این باره وجود ندارد، اما بعضی از پزشکان و بیماران بر این باورند که مصرف الکل، گوجه، کافئین، شکلات، ادویه های تند، نوشیدنی های مرکباتی و غذاهای دارای اسید بالا، می توانند باعث ورم بیشتر مثانه شوند. لذا حذف این موارد از رژیم غذایی می تواند به کم شدن شدت علائم آزار دهنده ی بیماری کمک کند.

8_ کاهش مصرف دخانیات

سیگار کشیدن یکی از علل ثابت شده ی سرطان مثانه می باشد.

9_ورزش

می تواند سبب کم شدن برخی از علائم یا کمک به سرکوب بیماری و جلوگیری از تکرار آن باشد.