کلامیدیا با داروهای آنتی بیوتیک قابل درمان است. این داروها از راه خوراکی مصرف می شوند. از آنجا که فرد و شریک جنسی او، هر دو به بیماری مبتلا شده اند، هر دوی آن ها باید تحت درمان قرار بگیرند. به دنبال شروع درمان، عفونت معمولا طی 7 روز برطرف می شود. مصرف داروها حتی پس از برطرف شدن علائم نیز باید ادامه داشته باشد.

در صورتی که بیمار برای درمان از داروهای فرد دیگری استفاده کند، درمان بیماری ممکن است دشوارتر شود. فرد مبتلا باید به هرکسی که در 3 ماه گذشته با او رابطه جنسی داشته بیماری خود را اطلاع دهد. این کار از آنجایی اهمیت دارد که ابتلا به کلامیدیا ممکن است هیچ علائمی نداشته باشد (به ویژه در زنان) و در نتیجه ممکن است درمان نشود. 

تا زمانی که دوره درمان و مصرف داروها به پایان نرسیده، بیمار باید از برقراری رابطه جنسی خودداری کند. فرد مبتلا به کلامیدیا باید از نظر داشتن HIV و سایر بیماری های مقاربتی از جمله سفلیس، هرپس و سوزاک نیز بررسی شود.